不能翻建的原因主要包括以下几点：不符合乡镇总体规划：农村自建房必须符合乡镇总体规划，如果不符合，则不允许进行翻修或翻建。审批手续未通过：农村自建房的审批手续越来越严格，如果审批手续未能通过，则不允许进行翻修或翻建。位于水资源保护区或生态保护区：在水资源保护区或生态保护区，不允许进行房屋的翻修或翻建。